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空間生物學(xué),臨床應(yīng)用未來

更新時間:2026-01-20      點擊次數(shù):116

Cell dive助力《Science》發(fā)表,參見2025年 KLF2 maintains lineage fidelity and suppresses CD8 T cell exhaustion during acute LCMV infection 一文。


“2025年12月31日,國際期刊《Cancer Cell》發(fā)表德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心王凌華教授團(tuán)隊的一篇空間組學(xué)重要綜述。文章指出空間組學(xué)技術(shù)已步入成熟期,它通過揭示腫瘤細(xì)胞與微環(huán)境在組織原位的空間組織、相互作用和演化規(guī)律,以準(zhǔn)確的精度重塑我們對癌癥的認(rèn)知空間組學(xué)技術(shù)不僅是強大的科研工具,更逐步成為下一代精準(zhǔn)腫瘤學(xué)的臨床基石。"


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2025年2月14日,美國耶魯大學(xué)Nikhil S. Joshi課題組Eric Fagerberg , John Attanasio , Christine Dien 等學(xué)者在《Science》 發(fā)布- KLF2 maintains lineage fidelity and suppresses CD8 T cell exhaustion during acute LCMV infection,關(guān)于LCMV急性感染期間KLF2維持譜系保真度并抑制CD8 T細(xì)胞耗竭的研究。


空間生物學(xué),臨床應(yīng)用未來

在免疫應(yīng)答過程中,天然CD8 T細(xì)胞有潛力分化成功能狀態(tài)廣泛的細(xì)胞譜系。本研究采用基于CRISPR-Cas9 in vivo 核酸干擾評估T細(xì)胞命運決定中的約40種轉(zhuǎn)錄因子(TFs)和表觀遺傳調(diào)節(jié)模塊,意外發(fā)現(xiàn)敲除TF Klf2導(dǎo)致急性感染期間異常分化成耗竭樣CD8 T細(xì)胞。KLF2用來抑制促進(jìn)耗竭的TF TOX,同時也是維持多功能腫瘤特異性祖細(xì)胞狀態(tài)的關(guān)鍵。該結(jié)果表明KLF2提供效應(yīng)CD8 T細(xì)胞譜系保真度,抑制耗竭程序。刷新認(rèn)知:傳統(tǒng)認(rèn)為T細(xì)胞衰竭僅發(fā)生在慢性抗原環(huán)境中,本研究證明急性感染中也存在衰竭程序,但被KLF2主動抑制。

該研究構(gòu)建了全面的分化空間圖譜(DSM),整合急性和慢性LCMV感染多個時間點(第4、8、28、40天)的單細(xì)胞數(shù)據(jù),揭示急性感染呈線性分化軌跡,慢性感染呈分叉軌跡(效應(yīng)vs衰竭),為理解T細(xì)胞命運決定提供了研究框架。轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)意義,KLF2過表達(dá)可抑制衰竭特征并促進(jìn)效應(yīng)分化,為腫瘤免疫治療提供新的干預(yù)靶點。

該研究中顯微成像設(shè)備為

Cell DIVE 超多標(biāo)組織成像分析系統(tǒng)

01產(chǎn)品特點

多重免疫熒光成像:可同時檢測超多標(biāo)記物(可在一張切片對多達(dá)60個以上的markers成像)。

自發(fā)熒光控制:采用染料失活技術(shù)消除背景。

高分辨率:可觀察組織內(nèi)細(xì)胞空間分布,結(jié)合Aivia空間分析功能,完成空間生物學(xué)超多標(biāo)批量處理,快速獲得研究洞察。

02該研究中的價值

驗證異常分化的

空間生物學(xué)免疫微環(huán)境

發(fā)現(xiàn)KLF2缺失的T細(xì)胞在第8天更多定位在髓區(qū),提示其分化狀態(tài)與正常效應(yīng)T細(xì)胞的組織分布模式不同。

排除位置依賴性假說

分析數(shù)據(jù)支持KLF2的作用是位置獨立的,主要通過內(nèi)在轉(zhuǎn)錄調(diào)控而非微環(huán)境位置決定細(xì)胞命運。

03與其他技術(shù)的互補性

顯微成像提供關(guān)鍵的空間信息,流式細(xì)胞術(shù)提供定量表型數(shù)據(jù),單細(xì)胞測序提供轉(zhuǎn)錄組信息,ATAC-seq提供表觀遺傳信息,四者結(jié)合形成完整的研究體系。

豐富的研究方法將進(jìn)一步深化細(xì)胞命運決定的理解,并可能帶來新的免疫治療策略。空間生物學(xué),臨床應(yīng)用未來!

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